Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFIAQ12857 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms