Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EFEMP1Q12805 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms