Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YGR182CYGR182C 354 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 NBL1YHR199C-A 222 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 UTP11YKL099C 753 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 ATP3YBR039W 936 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 BFR1YOR198C 1413 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 GNT1YOR320C 1476 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 ROT2YBR229C 2865 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 PMI40YER003C 1290 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YFL032WYFL032W 321 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YLR152CYLR152C 1731 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 POL12YBL035C 2118 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 FUI1YBL042C 1920 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YMR221CYMR221C 1515 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 SCW10YMR305C 1170 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 THP1YOL072W 1368 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 CDC33YOL139C 642 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 TMC1YOR052C 453 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YAR1YPL239W 603 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 TUL1YKL034W 2277 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 IMA1YGR287C 1770 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 STP1YDR463W 1560 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 TDH3YGR192C 999 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 NIT2YJL126W 924 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 MRPL38YKL170W 417 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YPL062WYPL062W 405 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 snR17bsnR17b 332 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YJL206CYJL206C 2277 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 APP1YNL094W 1764 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 PHO8YDR481C 1701 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 PEX29YDR479C 1665 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 MSH1YHR120W 2880 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 ZUO1YGR285C 1302 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 ARF2YDL137W 546 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 BSC2YDR275W 708 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 PPQ1YPL179W 1650 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 SYP1YCR030C 2613 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 PSE1YMR308C 3270 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 UBX7YBR273C 1311 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 snR59snR59 78 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 SDH7YDR511W 402 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 RIM9YMR063W 720 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 VTI1YMR197C 654 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 HHT2YNL031C 411 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 IMP4YNL075W 873 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 AFT2YPL202C 1251 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 WHI3YNL197C 1986 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 MON1YGL124C 1935 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YBR139WYBR139W 1527 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 ADE3YGR204W 2841 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 DSL1YNL258C 2265 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 RPS14AYCR031C 414 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 AHC2YCR082W 387 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 VOA1YGR106C 798 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 ICY1YMR195W 384 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 ERP4YOR016C 624 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YPL114WYPL114W 420 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 FRM2YCL026C-A 582 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YPS7YDR349C 1791 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 VPS27YNR006W 1869 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 SUL2YLR092W 2682 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 SHE4YOR035C 2370 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 RPC11YDR045C 333 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YDR537CYDR537C 606 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 SSP120YLR250W 705 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 NCS2YNL119W 1482 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 UBA2YDR390C 1911 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 RRI2YOL117W 1938 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 SPE1YKL184W 1401 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 PAH1YMR165C 2589 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YEH2YLR020C 1617 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 STE5YDR103W 2754 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 AXL2YIL140W 2472 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 LYS9YNR050C 1341 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YDL009CYDL009C 324 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YGR265WYGR265W 411 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 RPL39YJL189W 156 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YKL069WYKL069W 543 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 YLR031WYLR031W 561 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 PKR1YMR123W 369 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 HCH1YNL281W 462 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 CIN5YOR028C 888 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-NL1Q12391 IMD3YLR432W 1572 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 GYP6YJL044C 1377 nt4.53□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 THS1YIL078W 2205 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 RTR2YDR066C 591 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YDR274CYDR274C 372 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YER038W-AYER038W-A 381 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YER084WYER084W 387 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YGR053CYGR053C 852 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 TRX2YGR209C 315 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 RPS24BYIL069C 408 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 LSM8YJR022W 330 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 YNL276CYNL276C 396 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 FMP25YLR077W 1752 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 SDS23YGL056C 1584 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-NL1Q12391 NDC1YML031W 1968 nt4.51□□□□□ -1.69
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