Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YLR169WYLR169W 354 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 FYV6YNL133C 522 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 PFY1YOR122C 381 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 IRC13YOR235W 315 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 RPS10AYOR293W 318 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 TSC11YER093C 4293 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 MNT3YIL014W 1893 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 COM2YER130C 1332 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 STE23YLR389C 3084 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YDL050CYDL050C 372 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 ARF1YDL192W 546 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 SHR3YDL212W 633 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 HTD2YHR067W 843 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YHR097CYHR097C 1101 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 ERG20YJL167W 1059 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 FIP1YJR093C 984 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 PIR1YKL164C 1026 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YLR012CYLR012C 300 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YLR365WYLR365W 333 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 RPL6AYML073C 531 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YBL028CYBL028C 321 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YMR099CYMR099C 894 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YNR062CYNR062C 984 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 TIM12YBR091C 330 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 SLI1YGR212W 1407 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 UBP14YBR058C 2346 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 RIX1YHR197W 2292 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 PMR1YGL167C 2853 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 TLC1TLC1 1301 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YDL157CYDL157C 357 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 EFG1YGR271C-A 702 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YHL005CYHL005C 393 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 VPS25YJR102C 609 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YKL222CYKL222C 2118 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YLL037WYLL037W 381 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 NEJ1YLR265C 1029 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YLR297WYLR297W 390 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 TEM1YML064C 738 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 BUD21YOR078W 645 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 YPL107WYPL107W 747 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 CCL1YPR025C 1182 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 snR44snR44 211 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 PUF6YDR496C 1971 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 SOK1YDR006C 2706 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 ITC1YGL133W 3795 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 FLO5YHR211W 3228 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 SNQ2YDR011W 4506 nt2.96□□□□□ -1.93
LDB17Q12342 SPH1YLR313C 1593 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 GYL1YMR192W 2163 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YCR100CYCR100C 951 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 SNU23YDL098C 585 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 MIX14YDR031W 366 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YPR1YDR368W 939 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 VMA8YEL051W 771 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YGL204CYGL204C 306 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YGR111WYGR111W 1203 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 MET14YKL001C 609 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 SSU72YNL222W 621 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 TPO5YKL174C 1857 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YME2YMR302C 2553 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 SEC27YGL137W 2670 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 DIA2YOR080W 2199 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 SRC1YML034W 2505 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YDR131CYDR131C 1671 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 AST2YER101C 1293 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 RPL23BYER117W 414 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 RPS25AYGR027C 327 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YAL064WYAL064W 285 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 UBC12YLR306W 567 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 END3YNL084C 1050 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 FIG1YBR040W 897 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 BTS1YPL069C 1008 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 PRM4YPL156C 855 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 SEC7YDR170C 6030 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 PAM1YDR251W 2493 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 ERG11YHR007C 1593 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 SLS1YLR139C 1932 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 LSM4YER112W 564 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 SMA2YML066C 1110 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 DIA1YMR316W 1011 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YBR116CYBR116C 528 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 YBR300CYBR300C 498 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 SLH1YGR271W 5904 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 RTG3YBL103C 1461 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 NET1YJL076W 3570 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 ATG13YPR185W 2217 nt2.93□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 WHI3YNL197C 1986 nt2.93□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 MRH1YDR033W 963 nt2.93□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 BMH2YDR099W 822 nt2.93□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 DYN2YDR424C 279 nt2.93□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 MEI4YER044C-A 1227 nt2.93□□□□□ -1.94
LDB17Q12342 RPL22BYFL034C-A 369 nt2.93□□□□□ -1.94
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