Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 CIT1YNR001C 1440 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 HUL5YGL141W 2733 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 GRS2YPR081C 1857 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 DAP2YHR028C 2457 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 ECM16YMR128W 3804 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 GAC1YOR178C 2382 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 RRN6YBL014C 2685 nt3.66□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 SNT1YCR033W 3681 nt3.65□□□□□ -1.82
LCB4Q12246 snR56snR56 88 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 snR9snR9 187 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 DAD1YDR016C 285 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YDR340WYDR340W 303 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 THO1YER063W 657 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 SPI1YER150W 447 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 SCEIQ0160 708 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 TMA19YKL056C 504 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 GTT2YLL060C 702 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YOR203WYOR203W 354 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RPA43YOR340C 981 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 CSM4YPL200W 471 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 FMP25YLR077W 1752 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 MSD1YPL104W 1977 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 NUP133YKR082W 3474 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YOL019WYOL019W 1656 nt3.65□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 STE24YJR117W 1362 nt3.64□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YKL075CYKL075C 1353 nt3.64□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YDL199CYDL199C 2064 nt3.64□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 ARP5YNL059C 2268 nt3.64□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YCR001WYCR001W 315 nt3.64□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 DSE2YHR143W 978 nt3.64□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YRO2YBR054W 1035 nt3.64□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 CUR1YPR158W 759 nt3.64□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RTT109YLL002W 1311 nt3.64□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RAD54YGL163C 2697 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 TRX3YCR083W 384 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RRP42YDL111C 798 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RPS18AYDR450W 441 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 GOS1YHL031C 672 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 BET4YJL031C 984 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YML053CYML053C 639 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 SPC29YPL124W 762 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 DER1YBR201W 636 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 FYV5YCL058C 459 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 OAF3YKR064W 2592 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 APE2YKL157W 2859 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 TAF7YMR227C 1773 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RNA14YMR061W 2034 nt3.63□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 PBP4YDL053C 558 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YDR090CYDR090C 933 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YGL082WYGL082W 1146 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 EMC2YJR088C 879 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 PIR1YKL164C 1026 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 ILV5YLR355C 1188 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YLR428CYLR428C 345 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YNL203CYNL203C 612 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YML096WYML096W 1578 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 PGS1YCL004W 1566 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 TPO5YKL174C 1857 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 ELM1YKL048C 1923 nt3.62□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 NAT1YDL040C 2565 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 CHD1YER164W 4407 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YGL140CYGL140C 3660 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YCT1YLL055W 1596 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 CHK1YBR274W 1584 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YCR013CYCR013C 648 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 VAB2YEL005C 849 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 TAM41YGR046W 1158 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 SLX9YGR081C 633 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YJL114WYJL114W 681 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 VMA5YKL080W 1179 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RPL17AYKL180W 555 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YMR144WYMR144W 1029 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 OCA2YNL056W 594 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YNL276CYNL276C 396 nt3.61□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 AVT7YIL088C 1473 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 ABP140YOR239W 1887 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YDL163WYDL163W 303 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RPA14YDR156W 414 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 PEA2YER149C 1263 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RPF1YHR088W 888 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 SNX4YJL036W 1272 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YKL070WYKL070W 510 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YLL044WYLL044W 447 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 IDP2YLR174W 1239 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 RAD14YMR201C 1116 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YNL109WYNL109W 546 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 HUB1YNR032C-A 222 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 TCO89YPL180W 2400 nt3.6□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 ANR2YKL047W 1551 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 IMH1YLR309C 2736 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 POL1YNL102W 4407 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YTA7YGR270W 4140 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 MFA1YDR461W 111 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 YAP5YIR018W 738 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 ENT3YJR125C 1227 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 SRP21YKL122C 504 nt3.59□□□□□ -1.83
LCB4Q12246 COQ9YLR201C 783 nt3.59□□□□□ -1.83
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