Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 LSM8YJR022W 330 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 ECM4YKR076W 1113 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YAR069CYAR069C 294 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 GOT1YMR292W 417 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 FYV6YNL133C 522 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 IRC13YOR235W 315 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 LCL1YPL056C 306 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YBR292CYBR292C 372 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 SKT5YBL061C 2091 nt3.08□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 SKO1YNL167C 1944 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YBR259WYBR259W 2067 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YCR085WYCR085W 354 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 AI3Q0060 1248 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 HMO1YDR174W 741 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 BUD26YDR241W 288 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YGL177WYGL177W 348 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 HTD2YHR067W 843 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 MRPL38YKL170W 417 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 GSP1YLR293C 660 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 CSM3YMR048W 954 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YNL203CYNL203C 612 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 KHA1YJL094C 2622 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 VHR2YER064C 1518 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 AI4Q0065 1671 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 REC8YPR007C 2043 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 ATG13YPR185W 2217 nt3.07□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YPD1YDL235C 504 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 DPP1YDR284C 870 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 TCA17YEL048C 459 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 NSA2YER126C 786 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YFH7YFR007W 1062 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 ITC1YGL133W 3795 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 PXR1YGR280C 816 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 DAD2YKR083C 402 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 REC102YLR329W 795 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YMR099CYMR099C 894 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 DLT1YMR126C 1029 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 MIC27YNL100W 705 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 TAF3YPL011C 1062 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 AFT2YPL202C 1251 nt3.06□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YJL175WYJL175W 513 nt3.05□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 CCE1YKL011C 1062 nt3.05□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 VMA6YLR447C 1038 nt3.05□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 RPL6BYLR448W 531 nt3.05□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 PRM6YML047C 1059 nt3.05□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 SUB1YMR039C 879 nt3.05□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 SYO1YDL063C 1863 nt3.05□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 FKH2YNL068C 2589 nt3.05□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YDR061WYDR061W 1620 nt3.04□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 STE23YLR389C 3084 nt3.04□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 SHQ1YIL104C 1524 nt3.04□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YSP2YDR326C 4317 nt3.04□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 PSY2YNL201C 2577 nt3.04□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 BOS1YLR078C 735 nt3.04□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YNL043CYNL043C 321 nt3.04□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 MDM36YPR083W 1740 nt3.04□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 MSH4YFL003C 2637 nt3.04□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YTA7YGR270W 4140 nt3.03□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 EXO5YBR163W 1758 nt3.03□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YDR491CYDR491C 492 nt3.03□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YGR168CYGR168C 1131 nt3.03□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YBR013CYBR013C 390 nt3.03□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 TIM12YBR091C 330 nt3.03□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 CIN8YEL061C 3003 nt3.03□□□□□ -1.92
NFI1Q12216 YDR124WYDR124W 975 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 HIM1YDR317W 1245 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YGL159WYGL159W 1113 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 PSF2YJL072C 642 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YJL169WYJL169W 369 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 AIM26YKL037W 357 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 PDR17YNL264C 1053 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 INO4YOL108C 456 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 CMD1YBR109C 444 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 TFC4YGR047C 3078 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 GWT1YJL091C 1473 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 AI2Q0055 2565 nt3.02□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 PCI8YIL071C 1335 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YGR160WYGR160W 612 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 MBR1YKL093W 1020 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YLR365WYLR365W 333 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 ERV41YML067C 1059 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YML090WYML090W 387 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 ATP11YNL315C 957 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 HUT1YPL244C 1020 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 RGR1YLR071C 3249 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 MUB1YMR100W 1863 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 MET6YER091C 2304 nt3.01□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 CDC20YGL116W 1833 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 CHS2YBR038W 2892 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 MET5YJR137C 4329 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 DAL2YIR029W 1032 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 INP1YMR204C 1263 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 RPL20AYMR242C 519 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 MPD2YOL088C 834 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 CAF120YNL278W 3183 nt3□□□□□ -1.93
NFI1Q12216 MMS1YPR164W 4224 nt3□□□□□ -1.93
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