Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 NNT1YLR285W 786 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YNL013CYNL013C 378 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YNL184CYNL184C 327 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YOR062CYOR062C 807 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YOR366WYOR366W 354 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 PET20YPL159C 762 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 REG1YDR028C 3045 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 RPN1YHR027C 2982 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 MYO5YMR109W 3660 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 ARO1YDR127W 4767 nt3.23□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YPS6YIR039C 1614 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YHR080CYHR080C 4038 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 CSR2YPR030W 3366 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YOR296WYOR296W 3870 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 DOA4YDR069C 2781 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 HFM1YGL251C 3564 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YGR039WYGR039W 312 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 LST7YGR057C 729 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YGR073CYGR073C 372 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 RHO5YNL180C 996 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 RSM19YNR037C 276 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 TIM12YBR091C 330 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YBR116CYBR116C 528 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 TAF2YCR042C 4224 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 GCN1YGL195W 8019 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 RTG3YBL103C 1461 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 CHO2YGR157W 2610 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 MSH2YOL090W 2895 nt3.22□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 IRC3YDR332W 2070 nt3.21□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 SSE2YBR169C 2082 nt3.21□□□□□ -1.89
VPS54Q12071 snR68snR68 136 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 MFA1YDR461W 111 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 RPS21BYJL136C 264 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 VMA5YKL080W 1179 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YAL064WYAL064W 285 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YOL106WYOL106W 354 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YOR097CYOR097C 528 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 MCA1YOR197W 1299 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 EPL1YFL024C 2499 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 CDH1YGL003C 1701 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 PSP1YDR505C 2526 nt3.21□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 UBP8YMR223W 1416 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YDL180WYDL180W 1644 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 GUK1YDR454C 564 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 DOG2YHR043C 741 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 POL32YJR043C 1053 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 RPL17AYKL180W 555 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YLR012CYLR012C 300 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YLR400WYLR400W 474 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YOL114CYOL114C 609 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 SRL1YOR247W 633 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 CUP9YPL177C 921 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 SPT14YPL175W 1359 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 FAA2YER015W 2235 nt3.2□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 COM2YER130C 1332 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 DRS2YAL026C 4068 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 BEM4YPL161C 1902 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YDL157CYDL157C 357 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 RPN9YDR427W 1182 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YGL082WYGL082W 1146 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YGL242CYGL242C 546 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 APC9YLR102C 798 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 SMD3YLR147C 306 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 DPB3YBR278W 606 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 HSE1YHL002W 1359 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 STP2YHR006W 1626 nt3.19□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YSP2YDR326C 4317 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 PPH3YDR075W 927 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 TVP15YDR100W 432 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 RUB1YDR139C 234 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YBL065WYBL065W 345 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YNL226WYNL226W 411 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YNL276CYNL276C 396 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 HAT1YPL001W 1125 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 LTP1YPR073C 486 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 SRP68YPL243W 1800 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 STT4YLR305C 5703 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 MDM1YML104C 3384 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 SAD1YFR005C 1347 nt3.18□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 DSF2YBR007C 2211 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 RPL13AYDL082W 600 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 AIM11YER093C-A 414 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 SVP26YHR181W 687 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YKR011CYKR011C 1062 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YAL066WYAL066W 309 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 SFH1YLR321C 1281 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 TEM1YML064C 738 nt3.17□□□□□ -1.9
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