Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 NDL1YLR254C 570 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 ATP3YBR039W 936 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 DAD3YBR233W-A 285 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YPK1YKL126W 2043 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 HUL5YGL141W 2733 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 MRS2YOR334W 1413 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 MNT3YIL014W 1893 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 TPO5YKL174C 1857 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 TPS2YDR074W 2691 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YGL176CYGL176C 1665 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 ERP3YDL018C 678 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 PCL9YDL179W 915 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YGR039WYGR039W 312 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 DID4YKL002W 699 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 REX3YLR107W 1215 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 RPL20AYMR242C 519 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 ATP11YNL315C 957 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 snR11snR11 258 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SPS4YOR313C 1017 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SIP3YNL257C 3690 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 DSS1YMR287C 2910 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 PCL7YIL050W 858 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SNX4YJL036W 1272 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 MRPS17YMR188C 714 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YOR062CYOR062C 807 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SYC1YOR179C 567 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 ISU1YPL135W 498 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 POS5YPL188W 1245 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 MRP2YPR166C 348 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 TMN3YER113C 2121 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SWR1YDR334W 4545 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 TFC3YAL001C 3483 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 FIN1YDR130C 876 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 HTA1YDR225W 399 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 GET1YGL020C 708 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 PEX14YGL153W 1026 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 EPT1YHR123W 1176 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YOL050CYOL050C 321 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 HAT1YPL001W 1125 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YPL035CYPL035C 348 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YPR027CYPR027C 834 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YPR078CYPR078C 1119 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 KAR4YCL055W 1008 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 ABD1YBR236C 1311 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SAP185YJL098W 3177 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 MED1YPR070W 1701 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 GYL1YMR192W 2163 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SUL1YBR294W 2580 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 FKS3YMR306W 5358 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SOK1YDR006C 2706 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 MON1YGL124C 1935 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SPO16YHR153C 597 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YKL075CYKL075C 1353 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YAL069WYAL069W 315 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 REC102YLR329W 795 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 UBP15YMR304W 3693 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YBL094CYBL094C 333 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YOR331CYOR331C 558 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SRP68YPL243W 1800 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 RFC5YBR087W 1065 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YML096WYML096W 1578 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 PDR11YIL013C 4236 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YDL050CYDL050C 372 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 ARF1YDL192W 546 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 RPL27BYDR471W 411 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YLR076CYLR076C 423 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 COA4YLR218C 453 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 INP1YMR204C 1263 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 YNL203CYNL203C 612 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 ACM1YPL267W 630 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 NEW1YPL226W 3591 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 VIP1YLR410W 3441 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 SGM1YJR134C 2124 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG41Q12048 IRA2YOL081W 9240 nt2.03□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 SLN1YIL147C 3663 nt2.03□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 DSE4YNR067C 3354 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 ECM18YDR125C 1362 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 PSK1YAL017W 4071 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 RRP42YDL111C 798 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 PCL2YDL127W 927 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 LRS4YDR439W 1044 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 NSA2YER126C 786 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 YBL028CYBL028C 321 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 YBL055CYBL055C 1257 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 YBL081WYBL081W 1107 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 RPS12YOR369C 432 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 RED1YLR263W 2484 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 BNI4YNL233W 2679 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 PSY2YNL201C 2577 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 PSD2YGR170W 3417 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 MCM21YDR318W 1107 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 PRE1YER012W 597 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 YGR073CYGR073C 372 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG41Q12048 EMC6YLL014W 327 nt2.01□□□□□ -2.09
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