Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YNL235CYNL235C 432 nt3.98□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 YOR203WYOR203W 354 nt3.98□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 APD1YBR151W 951 nt3.98□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 MCD4YKL165C 2760 nt3.98□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 SWH1YAR042W 3567 nt3.98□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 KIP3YGL216W 2418 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 SPR3YGR059W 1539 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 RPS29BYDL061C 171 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 TGL2YDR058C 981 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 MFA1YDR461W 111 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 CNN1YFR046C 1086 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 SLX9YGR081C 633 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 RPB3YIL021W 957 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 SNX4YJL036W 1272 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 PIR1YKL164C 1026 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 MRPL3YMR024W 1173 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 SUS1YBR111W-A 291 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 SEC6YIL068C 2418 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 SEG1YMR086W 2883 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 STP1YDR463W 1560 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 ANR2YKL047W 1551 nt3.97□□□□□ -1.77
VHS3Q08438 PEP7YDR323C 1548 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 SIN4YNL236W 2925 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 FIN1YDR130C 876 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 FMP10YER182W 735 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 HIS5YIL116W 1158 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 EAF6YJR082C 342 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YET1YKL065C 621 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 RPL15BYMR121C 615 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 MSN1YOL116W 1149 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 AEP1YMR064W 1557 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 OSH2YDL019C 3852 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 TPO5YKL174C 1857 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 PPZ1YML016C 2079 nt3.96□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 RRP42YDL111C 798 nt3.95□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YGR045CYGR045C 363 nt3.95□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt3.95□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 COX2Q0250 756 nt3.95□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 ENT3YJR125C 1227 nt3.95□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 COQ9YLR201C 783 nt3.95□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 RBL2YOR265W 321 nt3.95□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YPR136CYPR136C 513 nt3.95□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 FAS1YKL182W 6156 nt3.95□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 PDR12YPL058C 4536 nt3.95□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 GPI10YGL142C 1851 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 IOC2YLR095C 2439 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 SPT6YGR116W 4356 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 AVT7YIL088C 1473 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 FUS2YMR232W 2034 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 KRE29YER038C 1395 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 TAM41YGR046W 1158 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 EMC2YJR088C 879 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YKL070WYKL070W 510 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 FYV7YLR068W 456 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YNL324WYNL324W 396 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 HUB1YNR032C-A 222 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 PCI8YIL071C 1335 nt3.94□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 IMD4YML056C 1575 nt3.93□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YPR003CYPR003C 2265 nt3.93□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 RPA14YDR156W 414 nt3.93□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YDR199WYDR199W 366 nt3.93□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt3.93□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 PEP4YPL154C 1218 nt3.93□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 MNL1YHR204W 2391 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 SMI1YGR229C 1518 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YDL187CYDL187C 330 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 AIM7YDR063W 450 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YAL004WYAL004W 648 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YLL044WYLL044W 447 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 UBX4YMR067C 1251 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 SAS2YMR127C 1017 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 MRPS9YBR146W 837 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 SLM2YNL047C 1971 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YOL075CYOL075C 3885 nt3.92□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 USA1YML029W 2517 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 snR68snR68 136 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YFL015CYFL015C 495 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 FAR7YFR008W 666 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 CIC1YHR052W 1131 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YIL029CYIL029C 429 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 RPL17BYJL177W 555 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 IDP2YLR174W 1239 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 ATP18YML081C-A 180 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 MRPL44YMR225C 297 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YNL057WYNL057W 333 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 SWS2YNL081C 432 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 FAT1YBR041W 2010 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YPR059CYPR059C 387 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 VHR1YIL056W 1923 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 RIM4YHL024W 2142 nt3.91□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 AFR1YDR085C 1863 nt3.9□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 NEL1YHR035W 1893 nt3.9□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 ERG11YHR007C 1593 nt3.9□□□□□ -1.78
VHS3Q08438 YDL228CYDL228C 642 nt3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.5 ms