Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAD51Q06609 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD51Q06609 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms