Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EGR4Q05215 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR4Q05215 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms