Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GBE1Q04446 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBE1Q04446 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms