Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB1Q02641 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms