Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms