Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms