Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms