Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms