Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK17Q00537 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms