Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC5Q00444 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms