Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFAMQ00059 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms