Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms