Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG7P83436 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG7P83436 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG7P83436 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG7P83436 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG7P83436 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG7P83436 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG7P83436 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms