Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA1P78396 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA1P78396 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms