Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIP4K2BP78356 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PIP4K2BP78356 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms