Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITX1P78337 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX1P78337 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITX1P78337 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITX1P78337 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITX1P78337 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITX1P78337 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITX1P78337 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms