Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOMO3P69849 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms