Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMC1P62191 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMC1P62191 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC1P62191 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC1P62191 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC1P62191 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC1P62191 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC1P62191 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC1P62191 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC1P62191 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMC1P62191 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms