Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S1P61966 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S1P61966 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S1P61966 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S1P61966 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S1P61966 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S1P61966 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S1P61966 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S1P61966 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP1S1P61966 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP1S1P61966 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms