Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK-21P61565 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVK-21P61565 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms