Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF3P61204 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF3P61204 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF3P61204 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms