Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP25P60880 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms