Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA3P59666 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms