Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL3P58872 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms