Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP9P55211 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP9P55211 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP9P55211 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP9P55211 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP9P55211 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP9P55211 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP9P55211 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP9P55211 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP9P55211 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP9P55211 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms