Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAPAP54920 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAPAP54920 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAPAP54920 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAPAP54920 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAPAP54920 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAPAP54920 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAPAP54920 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAPAP54920 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAPAP54920 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAPAP54920 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAPAP54920 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NAPAP54920 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAPAP54920 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAPAP54920 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms