Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB4P54760 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms