Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms