Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATN1P54259 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATN1P54259 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATN1P54259 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATN1P54259 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATN1P54259 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATN1P54259 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATN1P54259 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATN1P54259 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATN1P54259 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATN1P54259 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATN1P54259 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATN1P54259 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATN1P54259 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATN1P54259 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATN1P54259 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATN1P54259 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATN1P54259 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATN1P54259 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATN1P54259 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATN1P54259 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATN1P54259 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATN1P54259 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATN1P54259 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATN1P54259 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATN1P54259 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATN1P54259 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATN1P54259 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATN1P54259 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATN1P54259 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATN1P54259 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATN1P54259 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATN1P54259 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATN1P54259 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATN1P54259 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATN1P54259 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATN1P54259 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATN1P54259 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms