Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN3P54252 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN3P54252 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms