Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPAP53621 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPAP53621 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPAP53621 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPAP53621 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COPAP53621 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPAP53621 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COPAP53621 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPAP53621 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPAP53621 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COPAP53621 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPAP53621 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPAP53621 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPAP53621 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPAP53621 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPAP53621 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPAP53621 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms