Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCN3P51790 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCN3P51790 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCN3P51790 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCN3P51790 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCN3P51790 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCN3P51790 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms