Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SMARCA2P51531 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SMARCA2P51531 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms