Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB27AP51159 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms