Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRIM1P49642 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRIM1P49642 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRIM1P49642 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRIM1P49642 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRIM1P49642 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRIM1P49642 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRIM1P49642 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PRIM1P49642 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRIM1P49642 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRIM1P49642 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRIM1P49642 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRIM1P49642 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRIM1P49642 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRIM1P49642 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRIM1P49642 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRIM1P49642 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRIM1P49642 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRIM1P49642 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRIM1P49642 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRIM1P49642 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRIM1P49642 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRIM1P49642 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRIM1P49642 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PRIM1P49642 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRIM1P49642 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms