Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA4P48058 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms