Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC1P41238 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms