Protein–RNA interactions for Protein: P38840

ARO9, Aromatic amino acid aminotransferase 2, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 513 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARO9	P38840	UPF3	YGR072W	1164 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	RPA12	YJR063W	378 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	RPN13	YLR421C	471 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YNL235C	YNL235C	432 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	SHG1	YBR258C	429 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	MDM36	YPR083W	1740 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	CHD1	YER164W	4407 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	NRP1	YDL167C	2160 nt		3.55	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	FUN12	YAL035W	3009 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	MNL1	YHR204W	2391 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	ALG8	YOR067C	1734 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	BET4	YJL031C	984 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	EAF6	YJR082C	342 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YBL010C	YBL010C	843 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	ARG80	YMR042W	534 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YNL109W	YNL109W	546 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YNL122C	YNL122C	348 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	INO4	YOL108C	456 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	SPC29	YPL124W	762 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	APC5	YOR249C	2058 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	IRC3	YDR332W	2070 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	CAF130	YGR134W	3369 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	ASI3	YNL008C	2031 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YDL016C	YDL016C	303 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	SPC19	YDR201W	498 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YFL015C	YFL015C	495 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YIL029C	YIL029C	429 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YJL007C	YJL007C	315 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	RPL17B	YJL177W	555 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YJR157W	YJR157W	363 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	YBL028C	YBL028C	321 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	DSS4	YPR017C	432 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	SUC2	YIL162W	1599 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	VIP1	YLR410W	3441 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	SPT23	YKL020C	3249 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	VID27	YNL212W	2349 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ARO9	P38840	LST4	YKL176C	2487 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	ITT1	YML068W	1395 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	snR56	snR56	88 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YCR085W	YCR085W	354 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	TGL2	YDR058C	981 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	RPS13	YDR064W	456 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YDR271C	YDR271C	372 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	API2	YDR525W	330 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	HLR1	YDR528W	1272 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	NTF2	YER009W	378 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	SAE2	YGL175C	1038 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	COX18	YGR062C	951 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	TIM10	YHR005C-A	282 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YAP5	YIR018W	738 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	PBA1	YLR199C	831 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YLR400W	YLR400W	474 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	ATP18	YML081C-A	180 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	MRPL3	YMR024W	1173 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	ERG2	YMR202W	669 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YPL205C	YPL205C	345 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	RSC58	YLR033W	1509 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	TRK1	YJL129C	3708 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	NEL1	YHR035W	1893 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	SPR3	YGR059W	1539 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	FIN1	YDR130C	876 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	SCEI	Q0160	708 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	CIC1	YHR052W	1131 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	VPS63	YLR261C	327 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	RPL6B	YLR448W	531 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	RBL2	YOR265W	321 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	SEC66	YBR171W	621 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	MBA1	YBR185C	837 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	AFR1	YDR085C	1863 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	PPZ1	YML016C	2079 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YKL050C	YKL050C	2769 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	SEC2	YNL272C	2280 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	RPN6	YDL097C	1305 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	AVT7	YIL088C	1473 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YDR199W	YDR199W	366 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	MXR1	YER042W	555 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	FMP10	YER182W	735 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YGL108C	YGL108C	423 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YAL004W	YAL004W	648 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YJR111C	YJR111C	852 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YKE2	YLR200W	345 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	ASC1	YMR116C	960 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	MSN1	YOL116W	1149 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	KIP3	YGL216W	2418 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	GRS2	YPR081C	1857 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	SMI1	YGR229C	1518 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YCR045W-A	YCR045W-A	351 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	YDL187C	YDL187C	330 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ARO9	P38840	HTA1	YDR225W	399 nt		3.49	□□□□□ -1.85

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