Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPA9P38646 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPA9P38646 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms