Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 ECM13YBL043W 774 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YMR254CYMR254C 309 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 HUB1YNR032C-A 222 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 TSR4YOL022C 1227 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YPR136CYPR136C 513 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YBR090CYBR090C 369 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 GCD2YGR083C 1956 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 CPA2YJR109C 3357 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 SPT16YGL207W 3108 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 FAR8YMR029C 1572 nt3.08□□□□□ -1.92
AVT5P38176 PFK26YIL107C 2484 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 LOC1YFR001W 615 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 DLS1YJL065C 504 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 RAD33YML011C 534 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 GIM3YNL153C 390 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 MCA1YOR197W 1299 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YPL205CYPL205C 345 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 RDS2YPL133C 1341 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 RPN1YHR027C 2982 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 NOP56YLR197W 1515 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 SEA4YBL104C 3117 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 MTL1YGR023W 1656 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 SLM2YNL047C 1971 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YAK1YJL141C 2424 nt3.07□□□□□ -1.92
AVT5P38176 RPN6YDL097C 1305 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 TMA17YDL110C 453 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YDR018CYDR018C 1191 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 AI4Q0065 1671 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 MSW1YDR268W 1140 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 GPP2YER062C 753 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YGL082WYGL082W 1146 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 THG1YGR024C 714 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 PRP31YGR091W 1485 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 PMT6YGR199W 2280 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 EPT1YHR123W 1176 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YIL024CYIL024C 570 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 USA1YML029W 2517 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 SAS2YMR127C 1017 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YOR387CYOR387C 621 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YPL261CYPL261C 309 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 PHO88YBR106W 567 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 SIN4YNL236W 2925 nt3.06□□□□□ -1.92
AVT5P38176 ERB1YMR049C 2424 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 VPS17YOR132W 1656 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 ERG5YMR015C 1617 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 CST9YLR394W 1449 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YCL020WYCL020W 1317 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 snR5snR5 204 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 TRX3YCR083W 384 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 DAD1YDR016C 285 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 TVP15YDR100W 432 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 BI2Q0110 1272 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 VMA21YGR105W 234 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 POG1YIL122W 1056 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YIR014WYIR014W 729 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YJR087WYJR087W 351 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YLR050CYLR050C 486 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 CSI2YOL007C 1026 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YPL035CYPL035C 348 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YEL025CYEL025C 3567 nt3.05□□□□□ -1.92
AVT5P38176 ROD1YOR018W 2514 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 KIN4YOR233W 2403 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 CWH43YCR017C 2862 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YDL199CYDL199C 2064 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 STE24YJR117W 1362 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 MIT1YEL007W 2001 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 TMA20YER007C-A 546 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 MXR1YER042W 555 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 PUG1YER185W 912 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YGL159WYGL159W 1113 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YIP1YGR172C 747 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 QCR10YHR001W-A 234 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 FYV7YLR068W 456 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YNL181WYNL181W 1224 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YNL203CYNL203C 612 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 NIP7YPL211W 546 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 RXT2YBR095C 1293 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 LOS1YKL205W 3303 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 SSE2YBR169C 2082 nt3.04□□□□□ -1.92
AVT5P38176 TCB3YML072C 4638 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YPS7YDR349C 1791 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 BSC1YDL037C 987 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 TAM41YGR046W 1158 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YJR020WYJR020W 333 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 RPS21AYKR057W 264 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 SEN15YMR059W 387 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 GIS2YNL255C 462 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 RET3YPL010W 570 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 KAR4YCL055W 1008 nt3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms