Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 BNA6YFR047C 888 nt5.18□□□□□ -1.58
GEF1P37020 COX13YGL191W 390 nt5.18□□□□□ -1.58
GEF1P37020 ENV10YLR065C 546 nt5.18□□□□□ -1.58
GEF1P37020 YLR400WYLR400W 474 nt5.18□□□□□ -1.58
GEF1P37020 GCY1YOR120W 939 nt5.18□□□□□ -1.58
GEF1P37020 SRL1YOR247W 633 nt5.18□□□□□ -1.58
GEF1P37020 RPC40YPR110C 1008 nt5.18□□□□□ -1.58
GEF1P37020 IRC3YDR332W 2070 nt5.18□□□□□ -1.58
GEF1P37020 CHL1YPL008W 2586 nt5.18□□□□□ -1.58
GEF1P37020 SNU56YDR240C 1479 nt5.18□□□□□ -1.58
GEF1P37020 HNT2YDR305C 654 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 BRR6YGL247W 594 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 PCL5YHR071W 690 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 ARC18YLR370C 537 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 ASI2YNL159C 870 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 YNL181WYNL181W 1224 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 TPK2YPL203W 1143 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 snR17bsnR17b 332 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 BCK2YER167W 2556 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 ARP4YJL081C 1470 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 ALG8YOR067C 1734 nt5.17□□□□□ -1.58
GEF1P37020 FRT2YAL028W 1587 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 FRE4YNR060W 2160 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 RNT1YMR239C 1416 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 YGL039WYGL039W 1047 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 PXR1YGR280C 816 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 VMA10YHR039C-A 345 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 YIL141WYIL141W 390 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 NFU1YKL040C 771 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 YLR297WYLR297W 390 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 YPL088WYPL088W 1029 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 FRM2YCL026C-A 582 nt5.16□□□□□ -1.58
GEF1P37020 BRE5YNR051C 1548 nt5.15□□□□□ -1.58
GEF1P37020 SRD1YCR018C 666 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 THI13YDL244W 1023 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 AGA2YGL032C 264 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 MRM2YGL136C 963 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 COX2Q0250 756 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 PBA1YLR199C 831 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 AAR2YBL074C 1068 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YNL184CYNL184C 327 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 RPL18AYOL120C 561 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 CDC15YAR019C 2925 nt5.15□□□□□ -1.59
GEF1P37020 NUP133YKR082W 3474 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 REB1YBR049C 2433 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 BI2Q0110 1272 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YFL068WYFL068W 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 TDA8YAL064C-A 381 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 PBI2YNL015W 228 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YPT53YNL093W 663 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YNR021WYNR021W 1215 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 IDH2YOR136W 1110 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 TGL3YMR313C 1929 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 TRM44YPL030W 1704 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 EGT2YNL327W 3126 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 FRE3YOR381W 2136 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 KRE6YPR159W 2163 nt5.14□□□□□ -1.59
GEF1P37020 AVT7YIL088C 1473 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 UBP16YPL072W 1500 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 OSH2YDL019C 3852 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 HTA1YDR225W 399 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 BNA7YDR428C 786 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 RIP1YEL024W 648 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YER119C-AYER119C-A 372 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YGL108CYGL108C 423 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 FUR1YHR128W 651 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YHR212CYHR212C 336 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 SDH3YKL141W 597 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YKT6YKL196C 603 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YAR060CYAR060C 336 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 ATX1YNL259C 222 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 snR35snR35 204 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 SSB1YDL229W 1842 nt5.13□□□□□ -1.59
GEF1P37020 SHS1YDL225W 1656 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 THI20YOL055C 1656 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 SHE4YOR035C 2370 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 snR59snR59 78 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 CWC2YDL209C 1020 nt5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.4 ms